Организационно-методический отдел создан в 2018 году на основании приказа ФГАУ «НМИЦ «МНТК «Микрохирургия глаза» им. акад. С.Н. Федорова» Минздрава России от 20.06.2018 № 155 «Об организации работы национального медицинского исследовательского центра по профилю «Офтальмология».
Отдел занимается организационно-методической работой при реализации направлений деятельности национального медицинского исследовательского центра по профилю «Офтальмология».